Михаил Афанасьевич родился в июне 1922 года в д. Ульянкино Бубровского с/совета Белозерского района Вологодской области в семье крестьянина-середняка.

В 1937 году окончил 7 классов Бубровской НСШ, затем 1 курс Белозерского педучилища. С 1939 года началась трудовая деятельность: он работал заведующим избой-читальней, секретарем Чироковского и Бубровского сельсоветов, где проработал почти год и был уволен как не достигший совершеннолетия. С января 1940 вновь продолжил работу в качестве секретаря по статистике в Бубровской МТС. А с 16 апреля пришел на работу судебным исполнителем нарсуда 2 участка Белозерского района. В суде выполнял и общественную работу секретаря первичной комсомольской организации и члена месткома.

Объем работы судисполнителя зафиксирован в протоколе проверки работы. Так, среднемесячно в нарсуд 2 участка поступало 55 дел. У судебного исполнителя на день проверки на остатке имелось 15 дел, из них в стадии исполнения по растратам на 5,5 тысячи рублей.

С 5 августа 1941 года Ганин М. А. был уволен в связи с сокращением 2 участка нарсуда Белозерского района и в сентябре 1941 года призван в ряды РККА.

Свою первую награду – медаль «За отвагу» – получил будучи командиром саперного взвода 386-го отдельного батальона 29 июня 1944 года за успешное выполнение задания в районе дер. Лисья Яма Витебской области у высоты 227.5 8, 9 и 10 мая 1944 года под обстрелом противника. Он руководил работой взвода саперов по устройству проволочного заграждения забора лесного завала у опушки леса и минировал этот участок обороны. Взводом было установлено свыше 200 противотанковых мин.

30 июня и 1 июля 1944 года в районе деревни Брод на реке Березине под пулеметным обстрелом с самолета и бомбежкой с воздуха руководил работой взвода по устройству моста через реку. После первой бомбежки строительства переправы был контужен. Невзирая на это, продолжал руководить работой, чем обеспечил своевременное устройство моста и проход техники через реку Березину. За это Михаила Афанасьевича 17 июля 1944 года наградили орденом Красной Звезды.

Ночью 22 января 1945 года лейтенант Ганин М. А., имея задание инженерной разведки заданного маршрута движения, во главе взвода инженерной разведки выдвинулся вперед порядков пехоты. Подходя к городскому мосту города Инстенбург, обнаружил, что саперы противника готовят мост к подрыву. Оценив боевую обстановку и ценность сохранности моста, Ганин принял решение вступить в бой. Приведя подразделение в боевой порядок, с автоматно-ружейным огнем взвод бросился на противника и вынудил его к отступлению. Подойдя вплотную к мосту, наши саперы немедленно разминировали его, чем обеспечили успешную переправу наших войск в город.

Не считаясь с опасностью для жизни, лейтенант Ганин личным примером мужества воодушевлял саперов на выполнение боевого задания. 2 февраля 1945 года Ганин был награжден орденом Отечественной войны I степени.

В течение 4–12 апреля 1945 года под сильным огнем противника (район Варенген, Восточная Пруссия) командир разведвзвода лейтенант Ганин провел со своим подразделением 8 ночных поисков на переднем крае противника, в результате которых были обнаружены 3 минных поля противника.

В ночь на 12 апреля во время поиска был захвачен в плен немецкий обер-ефрейтор. Лейтенантом Ганиным были также доставлены ценные сведения о инженерных заграждениях противника, благодаря которым были приняты меры к их устранению, чем был обеспечен успешный пропуск танков через заграждения.

При проведении поисков проявил личное мужество и отвагу, за что 13 апреля 1945 года был награжден орденом Красной Звезды.